usecase2

Contexte :

• une equipe recherche soumet un projet (ex. comparaison de 4 espèces, données RNAseq, expression différentielle) : on doit faire les analyses
• imaginer l'analyse avec le fait qu'elle pourra être redemandée par une autre équipe
• tout n'est pas identique mais réfléchir aux étapes communes
• potentiellement plusieurs à travailler (ou reprise par une autre personne de la plateforme)

Objectifs de repoductibilité à atteindre :

• aller-retours réguliers avec l'équipe
• documenter le travail au fur et à mesure
• rendu final
• que l'équipe puisse refaire l'analyse seule (soit les former, soit qqch de clic bouton)

Moyens à mettre en place :

• identifier les outils tiers nécessaires pour réaliser le projet (avec leur version)
• outils pour : documenter, communiquer, faire le compte-rendu, empaqueter l'analyse et les outils
• choisir les ressources de calculs : en local, IFB, genotoul (+ de place mais + de monde-)

on réfléchi par ordre chronologique de développement :